MEGAResFrom MEG, the Microbial Ecology Group

sme

The SME genes encode Ambler class A beta-lactamases. The sme (note the lack of capitalization) genes encode resistance nodulation cell division (RND) efflux pumps under the regulation of SmeRS and SmeT.

References

Other Groups in Multi-drug efflux pumps

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ATGTCTCTCCTGCGCCCGCTGTCCCGTTCCCCGCGTCCCCTGCTGTTGCCCCTGCTGCTGGCCCTGGCGGCCTGTTCGGC
GGACAGGACCGACGCCCCGGCCATGCCCGAAGTGGGCGTCATCATCGCCAGCGCGCAGCCGCTGGCACTCCAGCAGACCT
TGCCCGGCCGTGCCGTGCCGTTCGAGATCTCCGAGGTGCGGCCGCAGATCGGCGGCCTGATCCGCCAGCGGTTGTTCACC
GAAGGCCAGCAGGTCAAGGCAGGGCAGCTGCTGTACCAGGTCGACCCGGCACCGTACCAGGCGGCCTTCGATACCGCCCG
CGGGCAGCTGGCGCAGGCCGAGGCCACCGTGTTGTCGGCACAGCCGAAGGCCGAGCGTACCCGCGCGCTGGTGAGCATGG
ATGCAGCCAGCAAGCAGGACGCCGACGATGCCACCTCGGCGTTGAAGCAGGCGCAGGCCAACGTGATTGCCGCGCGCGCT
GCATTGCAGGCTGCCCGCATCAACCTCGACTACACCCGGGTGACCGCCCCCATCGACGGTCGCATCGGCACCTCCAGCGT
CACCGCCGGCGCGCTGGTCGCGGCCGGCCAGGATACGGCGTTGACCACCATCCAGCGGCTGGACCCGGTGTACCTGGATG
TCACCCAGTCCAGCACGCAGATGCTGGCGCTGCGCAAGCGGCTCGATGCGGGCCTAGTGAAGGCCATCGATGGCAAGGCA
CAGGTTAAGGTGCTGCTGGAGGACGGCAGCACCTACGCGCATGAAGGCACGTTGGAGTTCGTCGGCAGCGCAGTGGATCC
GGGCACCGGAAACGTGAAGCTGCGCGCGGTCATTCCGAACCCGGACGGCCTGCTGTTGCCGGGCATGTACCTGAAGGCGG
TGCTGCCGATGGCCACCGACGCGCGTGCCCTGCTGGTGCCGCAGAAGGCAGTGGTGCGCAACGAACGCGGCGAACCGCTG
CTGCGCCTGCTCGACGCCAAGGATCATGTGGTCGAGCGCCGCGTCAGCACCGGCCAGGTGGTCGGTAACCAGTGGCAGAT
CACCAGCGGCCTCAAGGCTGGCGAACGGGTGATCGTCAGCAACGGCAGCGCGGTATCGCTCGGTCAGCAGGTGAAAGCGG
TGGCGCCCACGACGGCGCAGTTGGCGGCGATGCCGGCGGTCGATCCGAACGGCAACACCGACGAAAAGTCGCACTGA

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TCAGGGCTCGTAGCTGTAGCCCATGCCGTACACCGAACGGATCGGCTCGCCTTCCATGCCGGCGTCGGCCAGCTTGCGGC
GCAGGTTGCGCACATGGCTGTCGACGGTGCGGTCGACCACCACGCGATGGTCCAGGTACAGCCGGTCGAGCAGTTCATCG
CGCGCCCAGATCCGGCCTGGGGTGGCCAGCAGCGTGCGCAGCAGGCGGTACTCCACCGGCGTCAGGTCCAGGCCCTTGCC
GTTCCAGGTGGCGCGTGCGGCCGGCTCGTCGATGTGCAGGCCACCGTTGGCGCGCGCACCCGGGTCCGGGCGGTAGCGGC
GCAGCACCGCCATTACCCGCGCGACCACTTCGCGCGGACTGAACGGCTTGCAGATGTAGTCGTCGGCGCCGATCTCCAGG
CCCAGCAGGCGGTCGATCTCTTCCACCCGTGCGGTGACCATGATGACCGGTACATCGCTGCTGGCACGCAGTTCGCGGCA
CAGGTCCACGCCGTCGCGCTGCGGCAGCATCAGGTCCAGCAGCACCAGGTCGGGCTGGTAGCGCGCGAATGCGTCGATCA
CCTGGCCACCGTCGTCCACCCACTCGCTGGCCATGCCGGCGGCGGCCAGGTAGTCGCGCAGTACCGAGGCCAGGCGTGGC
TCGTCCTCGACGATCAGGATCTTCGTGGACGTGGCGGGCGACGTGCTCATG

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ATGAAGCCGATGCTGCTGCGCGCCCTGGCGGCCGCAACGATGACCACCGTGCTGGGCGGCTGCGTGAGCATGGCCCCGCA
CTACCAGCGTCCCGAGGCACCGGTGCCGGCGCAGTTCGGCAATGCTGCCATCGGCGCGGCCGAACCGGCACTGGCGATGC
CGGCCTGGCGCGACGTGTTCCTGGAACCGCGCCTGCAGCAGGTCATCGCGCTGGCGCTGCAGAACAACCGCGATCTGCGC
GTGGCGGTGCTGCAGGTGGAGAAGGAGCGCGCGCAGTACCGCATCCAGCGCGCGGCACTGCTGCCGTCGGTGGATGCCAG
CGGCAGTGTCACCCGTTCGCGGGTGAGCGATGCCAACAGCGAGACCGGCGTCACCCAGGTGACCGAATCCGATGCCGTGC
AGGTGGGCATCAGCAGCTGGGAGCTGGACCTGTTCGGGCGTATCCGCAGCTTGAAGAACGAGGCGCTGCAGAACTGGCTG
GCCAGCGCCGAGAACCAGCGCGCCGTGCGCACCAGCCTGGTGGCTGAAGTGGCGACGGCGTGGCTGGCGCTGGCGGCCGA
CGAGCAGTCGCTGGCATTCACGCAACAGACGCTGGACAGCCAGCACCAGACCCTGCAGCGCACCGAGGCCCGCCATGCAC
AGGGGCTGGCCTCGGGCCTGGACCTGTCGCAGGTGCAGACCAGCGTGGAAGCCGCGCGCGGGGCGCTGGCGAAGCTGCAG
GCCCAGCAGGCGCAGGATCGCGATGCATTGCAGCTGTTGGTGGGGGCACCGCTGGATCCGGCCCTGCTGCCAACCGCGCA
GGCGCTGGATGGCAGCGTCGCATTGGCGCCGCTGCCCGCCAACCTGCCGTCCAGCGTGTTGCTGCAGCGCCCGGACGTGC
TGTCCGCCGAGCATGCATTGCAGGCAGCCAACGCCGATATCGGTGCCGCGCGCGCCGCATTCTTTCCGACGCTGGCGTTG
ACCGCCAACTACGGCCACAGTTCCACCGCGTTGTCGACGCTGTTCTCGGCCGGCACCCGTGGCTGGTCGTTCGCGCCCAG
CATCACCGCGCCGATCTTCCATGCCGGTGCACTGAAGGCCTCGCTGGATGCCTCGAAGATCGGCAAGGACATCGGCATCG
CGCAGTACGAGAAGGCGATCCAGCAGGCCTTCAGTGAGGTGGCCGATGCGCTGGCCACGCGCGATCACCTGACCGCGCAG
CTGGACGCGCAACGCGCGTTGGTGGCTGACAGCCAGCGCAGCTACACCTTGGCCGATGCGCGCTACCGCACCGGACTGGA
TGGCTACCTGCAGTCGTTGGATGCGCAGCGCAGCCTGTATGCCGCGCAGCAGGACCTGATCGCCCTGCAGCAGCAGGAGG
CGGGCAACCGGGTGACGTTGTTCAAGGTGCTGGGTGGTGGCGCGGACGCGCGGTAA

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ATGGCACGCTTTTTCATCGATCGACCCATCTTTGCGTGGGTGATCGCCATCATCATCATGCTCGCCGGCGGCCTGGCGCT
GTTCAAGCTGCCGGTCTCGATGTACCCCAACGTCGCACCGCCGGCGGTGGAAATCAGCGCCACCTACCCGGGTGCATCGG
CCAAGGTGGTCGAGGACTCGGTGACGCAGATCATCGAGCAGAACATGAAGGGCCTTGATGGCCTGATCTACTTCTCCTCC
AACAGCTCGTCCAACGGCCAGGCCACCATCACCCTGACCTTCGAGAGCGGCACCAACCCGGATATCGCCCAGGTGCAGGT
GCAGAACAAGCTGCAGCTGGCCATGCCGCTGCTGCCGCAGGAAGTGCAGCGGCAGGGCATCAACGTGGCCAAGTCCAGCT
CGGGCTTCCTGAACGCCATCGCGTTCGTGTCCGAGAACGGCAGCATGGACGCCAACGACATCGCCGACTACGTCGGTTCC
AATGTCGTCGACCGCCTGAGCCGCGTGCCGGGCGTGGGCAACATCCAGGTGTTCGGTGGCAAGTACGCCATGCGCATCTG
GCTGGACCCGAACAAGCTGCATACCTATGGCCTGTCGGTGCCGGAAGTGACCGCCGCGATCAAGGCGCAGAACGCCCAGG
TGGCGATCGGCCAGCTCGGCGGTGCGCCGTCGGTGAAGGGCCAGCAGCTCAACGCCACCATCAACGCGCAGTCGCGCCTG
CAGACCCCGGAACAGTTCCGAAACATCATCGTGCGCGGTGCGCAGGACGGTGCCGAGCTGCGCCTGGGTGATGTCGCCCG
CGTCGAGCTGGGTGCCGAGTCCTACGACTTCGTCACCCGCTACAACGGCCAGCCGGCCAGTGGCCTGGCGGTCACCCTGG
CCACCGGCGCCAACGCGCTGGATACCGCGGCCGGTGTGGATGCCGCGCTGGAAGACATGAAGGGCTTCTTCCCGGCCGGC
CTGAAGGCCGAGATCCCGTACGACACCACCCCGTTCGTGCGCGTGTCGATCAAGGGCGTGGTGCAGACCCTGATCGAAGC
GATCGTGCTGGTGTTCGTGGTGATGTACCTGTTCCTGCAGAACTTCCGCGCCACGCTGATCCCGACCATCGCCGTGCCGG
TGGTGCTGCTGGGTACCTTCGGCGTGCTGGCGATGCTGGGCTTCTCGGTGAACATGCTGACCATGTTCGCGATGGTGCTG
GCGATCGGCCTGCTGGTGGACGATGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCATCATGTCCGAGGAAGGGCTGTCGCC
GCTCGAAGCGACCCGCAAGTCGATGGGCCAGATCACCGGTGCGCTGGTGGGTATCGGCCTGGTGCTGTCGGCGGTGTTCG
TGCCGATGGCCTTCATGAGCGGCTCCACCGGCGTGATCTATCGCCAGTTCTCGGCCACGATTGTCTCTGCGATGGCGTTG
TCGGTGCTGGTGGCGATCGTGCTGACCCCGGCACTGTGCGCGACCATGCTCAAGCCGCTGAAGAAGGGTGAGCACCACGT
CGCCCACCGTGGCCTGGCCGGTCGCTTCTTCAATGGCTTCAACCGTGGCTTCGATCGCACCAGCGAAAGCTACCAGCGCG
GCGTGCGCGGCATCATCCACCGTCCGTGGCGCTTCATGGGCATCGTGGCGGCCTTGTTCGTGCTGATGGGCGTGCTGTTC
GTGCGCCTGCCCAGCTCGTTCCTGCCCAACGAAGACCAGGGTGTGCTGATGGCGCTGGTGCAGGCGCCGGTCGGTGCCAC
CCAGGAACGCACGCTGGAATCGATCGCGGCACTGGAAAACCACTTCCTGCAGAACGAGAAGGATGCGGTGGACTCGGTGT
TCTCCGTGCAGGGCTTCAGCTTCGCCGGCATGGGCCAGAACGCGGGCATGGCGTTCGTCAAGCTGAAGGACTGGAGCGAG
CGTGACGCCGACAATGGCGTGATGCCGATCACCGGACGTGCGATGGCGGCCCTGGGCCAGATCAAGGATGCCTTCATCTT
CGCCTTCCCGCCGCCGGCCATTCCGGAGCTGGGGACCGCCTCGGGCTACACCTTCTTCCTGAAGGACAACAGCGGCCAGG
GCCACGAGGCACTGGTGGCCGCGCGCAACCAGCTGCTCGGCCTGGCCGCAGGCAGCAAGAAGCTGGCCAACGTACGCCCG
AACGGCCAGGAAGACACGCCGCAGTTCCGCATCGACATCGACGCGGCCAAGGCGACCTCGCTGGGACTGTCGATCGACCA
GATCAACGGCACGCTGGCGGCCGCGTGGGGCAGCTCGTACATCGATGACTTCGTCGATCGTGGCCGCGTCAAGCGCGTGT
TCGTGCAGGCCGACCAGGCGTTCCGCATGGTGCCGGAGGACTTCGATCTCTGGTCCGTGAAGAACGACAAGGGTGAGATG
GTGCCGTTCAGCGCCTTCGCTACCAAGCACTGGGACTACGGTTCGCCGCGCCTGGAACGCTACAACGGTGTGTCGGCAAT
GGAAATCCAGGGCGAACCGGCCCCGGGTGTCGCCTCCGGTGATGCCATGGCCGAGATCGAACAGCTGGCCAAGCAGCTGC
CGGCGGGTTTCGGCATCGAATGGACGGCGATGTCCTACCAGGAACGCCAGGCCGGCTCGCAGACGCCGCTGCTGTACACG
CTGTCGCTGATGATCGTGTTCCTGTGCCTGGCCGCGATGTATGAAAGCTGGAGCGTACCGACCGCGGTGCTGCTGGCGGC
CCCGCTGGGTATCCTCGGCGCGGTGCTGGCCAACACCTTCAAGGGCCTGGAGCGCGACATCTACTTCCAGGTGGCGATGC
TGACCACGGTGGGCCTGACCAGCAAGAACGCGATCCTGATCGTCGAGTTCGCCAAGGAAAACCTGGAAAAGGGCGCCAGC
CTGATCGAGTCGATCATGCACGCCGTGCGCGACCGCCTGCGCCCGATCGTGATGACCTCGCTCGCCTTCGGCATGGGCGT
GGTACCGCTGGCGATCTCCACCGGTGCCGGCTCCGGCGCCAAGCAGGCGATCGGCACCGGCGTGCTCGGCGGCATGATCG
TCGGCACCGTGCTCGGCGTGTTCTTCGTGCCGCTGTTCTTCGTGGTGGTGCAGCGCGTGTTCAAGCGCAGATCCACGACG
TGA

>7|AF173226.1|AF173226|Multi-drug_resistance|Multi-drug_efflux_pumps|sme
ATGGTTCGTTTCTTCATCGACCGGCCGATCTTCGCCTGGGTGATCGCCATCGCGGTCAGCCTGCTCGGCCTGCTCGCGAT
CCTGATCCTGCCGGTGGACCGCTACCCGCAGATCGCCCCGCCCACCATCACCATCCGCGCCACCTACACCGGCGCCTCGT
CGCAGACCGTGGAAAACGCGGTCACCCAGGTCATCGAGCAGTCCCAGCAAAGCCTCGATCACCTGATGTACATGACCTCG
ACCAGTGCCTCCGACGGCTCGGCGCAGGTCAACCTGGTGTTCGCCACCGGTACCAATCCGGATACCGCGCAGGTGCAGGT
GCAGAACCAGCTGCAGGCCGCCATGGCCACGCTGCCGCAGGCGGTGCAGCAGAACGGCCTGACCATCACCAAGTCCAGTG
GTTCGATCTTCGAGGTGCTGTCGTTCACCAGCGAAGACGGCAGCATGGACAACTTCGATGTCGCCAACTTCATGGAAGCG
CGCATCGATGACCAGATCAGCCGCGTCAGCGGTGTCGGCAACATCCAGCCGATCGGCCAGGAATACGCCATGCGCATCTG
GCTGGATCCGGAGAAGATGCGCCAGTACGCGCTGATGCCCTGGGACATCGAGACCGCATTGCAGGCACAGAACACCGATG
TCTCCGCCGGTGAGCTGGGTGGCCAGCCGGCGCTGAAGGGCCAGCAGCTCGACGCCACGGTAACCGCGCGCAGCCGCCTG
CACACGCCCGAGCAGTTCGCGCAGGTGGTGCTCAAGGCCGATGCCAACGGCAGCGTGGTGCGTCTGGGCGACGTGGCAAA
GATCGGCCTCGGGCCGGAAAGCTACGACAGCATCAGCACCTTCAATGGCAAGCCGTCGGCGTCGCTGGGCATTGAACTCA
ATGCCGGTGCCAACGCGATCGCCGTCTCCAAGGCCATCGATGCACGGCTTCAGCAGCTGCAGAAGTACTGGCCGCATGGC
TACACCGCCCACGTGGCCTTCACCACCACCCCATTCGTGACCATTTCGCTGAAGGAAGTGGTGATCACCCTGATCGAAGC
GATCATCCTGGTGGTGCTGGTGATGTACCTGTTCCTGCAGAACTGGCGCGCCACGCTGATCCCGACCATCGCGGTGCCGG
TGGTGCTGCTGGGCACGTTCGGCGTGCTGGCTGCATTCGGGTATTCGATCAACACCCTGACCATGTTCGCACTGGTGCTG
GCCATCGGCCTGCTGGTGGACGATGCCATCGTGGTGGTGGAGAACGTAGAGCGGGTGATGACCTTCGAAGGGCTGGCGCC
GAAGCCGGCCACGCTGAAGGCGATGGGCCAGATCACCGGCGCGCTGGTCGGCATCGTGCTGGTGCTGACCGCGGTGTTCC
TGCCGATGGCGTTCTTCAGCGGTGTAACCGGGGTGATCTATCGCCAGTTCTCGGTGACGATCGCCGCCGCGATGATCCTG
TCGGTGCTGGTGGCGATGACCATCACCCCGGCACTGTGTGGCAGCATCCTGCACCAGATTCCCAAGGGCGGCCATCCGCA
TGGCGACCACGGTGGCGAGCCGAGCCTGCTGGGCAAGTTCTTCATCTGGTTCAACCACCGCTTCGAGCGCACCTCCAACG
GCCTGCGCCATCGCGTGGATCGTTTCCTCGGCCGCCGCACGCTCGGCGTGCTGTTCTACCTGGTGCTGAGCGTGGCCACC
GGCCTGTTGCTGTGGCACCTGCCGGGCGCGTTCCTGCCCGATGAAGACCAGGGCATGCTCAACGCGCTGGTGAAGCTGCC
GGCCGGTTCCACGCTGGAGCAGACGCGGGCGGTGATGGATCGTCTGAGTGCCGTCGCGGTGAAGGACGACGGCGTGCTCT
CGATCCAGGCCACCGCCGGTTTCAGTGTTACCGGCAGCGGCCAGAACGTCGGCCAGGCCTTCATCCGGCTGAAGGACTGG
GATGACCGCAAGGACGACGCCGATACCATCGCCGCACGCTTGACGCGGGCGATGGCCAGCGTGCCCGATGCGCAGGTGTT
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GCCATGCCGCCGCCGTGGCCGCGCGCAACACGCTGCTGAAGGAAGCCGCCAAGGACCCGAAGCTGGTCAACGTGCGCTAC
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TCATCCAGGGCACCGCCGAAGCACGCATGCAGCCGCAGGACATCGAGCGCTGGAGCGTGCGCAACCAGGCCGGGCAGATG
GTGCCGCTGTCGTCGTTGATCAGCACGCATTGGACCAGCGCGCCGGCCGCAGTGCAGCGCTACAACGGCATCTCGGCGAT
GGAAATCACCGGCCAGCCGGCACCGGGCGTCAGCTCCGGCGAGGCGATGGCCGAGATCGCGCGCCTGGCCGACACGCTGC
CGGAAGGCTTCAGCCATGCCTGGTCGGACATGGCCTACCAGGAACAGCTGTCGGGCAACCAGGCGCCGATGCTGTACGCC
ATCTCGCTGCTGTTCGTGTTCCTGTGCCTGGCCGCGCTGTATGAAAGCTGGGCGGTGCCGTTCGCGGTGATGCTGGCGGT
GCCGGTGGGCATGTTCGGCGCCGTGCTGATGATGAACCTGCGTGGCCTCAACAACGACGTGTACTTCCAGGTCGGCCTGC
TGACCACGATTGGTCTGGCAGCGAAGAACGGCATCCTGATCGTCGAGTTCGCGCGCATCCTCGAACAGCAGGGCAAGAGC
ACCCGCGAAGCGATCCTGCAGGCGGTCTACCTGCGGCTGCGGCCGATCGTAATGACCTCGCTGGCGTTCCTGATGGGCGT
ACTGCCGCTGGTGTTCGCCACCGGCGCCGGTTCGGCTGCGCGCCGTTCGCTGGGTACCGGCGTGGCCGGTGGTACGGTTG
CCTCGATGGTGCTGGGCATGTTCTTCGTGCCGTTGTTCTACCTGCTGGTGCGCCGCCTGTTCCCGGGCCGCGCGCCGGCC
GACGCCACTGTCCCGGAGACAAGCCCATGA

>CARD|phgb|AF173226|1037-2441|ARO:3003067|smeS|Multi-drug_resistance|Multi-drug_efflux_pumps|sme
TCATGCAGGCTCCGGCAGGGTGATGACCACGCGCAGCCCGCCCAGCGGCGAGGGCGCGGCGTGGATGACGCCGTGGTGGG
CGAGGATGATGTTGTGGCTGATGGCCAGGCCCAGCCCGCTGCCGCCACTGGCGCGGTTGCGCGAACTTTCCACGCGGTAG
AAGCGTTCGAACACCAGTGCACACTTGTCGGGCGGAACGCCCGGCGCGGTGTCTTCCACGACCAGCTGCACGCCGGCAGG
CACGCGCGCCGCCTGCACGCGTACGCGGCCACCGGCATGGGTGTAGCGCAGTGCGTTTTCCAGCAGGTTGGCCAGCACCT
GCTGCAGGCGCCGCTCGTCACCGGACACCTGCAACGGCGTGGCGGGCAGGTCTTCTTCCAACGCCAGGCCTGCATTGGCG
AAGCGCACGCGCATGCCATTGAGTTCGCTGCGCAGCAGCGCCACCAGGTCCAGTGGCGCGAAGCGGTACGCCAGGCCGCC
GGACTGGGTCATCGACAGGTCGTGCAGGTCGTCGATCAGCTTGCCCAGCTGGCGGATCTCGCCCTGCAGGCCCACCAGGT
TGGCCCGGTCCAGCGGACGGATGCCATCTTCGATCGCCTCCAGCTCGGCCCGCACCACGGCCAATGGCGTGCGCAGCTCA
TGCGAGATGTCGGCAATGAAGGCGCGGCGGTTGCGTTCGGTATCGTCCAGCGCCTGCGCCATCCGGTTGAAGTCGTTGAC
CAGCGCGTCCAGCTCATCGTCACTGGTGCGCTCGATGCGGGTGGCGTAGTCACCGGCGGCCAACCGGTGGGTGGCAGCGG
CCAGCTTGGCAAGGCGCTGGCGCAGCGCACGCGATACCAGCCAGGCCAGCAGTACCGTCACCAGCAGTAGCGCGATGCCG
ATCACCCACCAGGCGCGCACCTGGGTGTTGTAGAAATTCAGGTCGTTGGTGGCGATGACGGTCTGGAACGGCACCATGCC
CAGCCAACCGACGGTCTGCCCGTCCACCTGCACCGCATGCGGCTCGTCATCGCTGGTGGCGTCGGGGTTGCCGGCCACGA
AACGGTGCTGCGCGTCGAACAGGCCCAGGCGCGACGGCACGCCGGTCTGGTCGGACAGCGACGGCACCGGTCCTTCGTGC
CCATGGGCCAGGTCCGGGCGCAGCAGCCGCGCCCAGCGGTCGCCATCACCGTGCAGATGCTCCCAGCCACCGTGCTCGCG
GTACTCGCGCTGCAGGTGTGGCATCAGCCGCTGCATGCGCAGGTCGCCCTGGTCGTTGAGGTAGTCCAGGAAGCCGGTCT
GGAAGGCCACGCGGCTGGCAATACCGTTCACTGCCAGCACCAGCAGGCAGGCGGTGAAGATCGCGAGGAAGGTCTTCGCG
GTCAGGCCGAATTTGAGTTGGAACTTCGCCATCGCGAAGGCCATT